De acordo com a ministra, assim que o TRF-1 decidir qual juízo é o competente para seguir com as apurações, os autos devem ser encaminhados. Cármen registrou, ainda, que caberá a tal juízo analisar as medidas cautelares deferidas por ela, como a suspensão de todos os processos em trâmite no Pará e do Amazonas relativos à Operação Handroanthus e a entrega do passaporte de Salles. Até lá, as medidas seguem em vigor.

Na decisão, a ministra registrou que, como Salles foi exonerado do ministério no último dia 23, não há mais a competência penal originária do STF para supervisionar o inquérito. Nessa linha, a ministra considerou que não poderia analisar alguns pedidos feitos nos autos do processo: um de autoria de uma madeireira, para que bens apreendidos pela Handroanthus fossem restituídos; e um recurso da defesa de Salles contra a retenção do passaporte.

Salles ainda é alvo de um outro inquérito que corre no STF e que também deve ser enviado à primeira instância. Tal caso está sob relatoria do ministro Alexandre de Moraes e investiga a suposta participação do ex-ministro num "grave esquema de facilitação ao contrabando de madeira". As apurações culminaram até em uma fase ostensiva, a Operação Akuanduba, ocasião na qual Salles foi alvo de buscas e Eduardo Bim foi afastado da presidência do Instituto Brasileiro do Meio Ambiente e dos Recursos Naturais Renováveis (Ibama).

Salles pediu demissão do Ministério do Meio Ambiente quando soube, no último dia 22, que Moraes determinaria sua prisão.